Galvenais uzdevums ir izstrādāt, īstenot un pārraudzīt valsts politiku veselības aprūpē, tādējādi nodrošinot un veicinot veselības profilaksi, popularizējot veselīgu dzīves veidu, radot nosacījumus, lai iedzīvotāji saņemtu izmaksu efektīvus, fiziski un finansiāli pieejamus un kvalitatīvus veselības aprūpes pakalpojumus.