Viņa nopelns ir jauns modelis skolas darbības organizēšanai, kurš modificētā veidā saglabājies pasaules praksē līdz pat mūsu dienām. J. A. Komenskis pirmo reizi cilvēces vēsturē pamatoja savstarpēji saistītu skolu sistēmu, izvirzīja jautājumu par skolas saikni ar dzīvi, izstrādāja klašu un mācību stundu sistēmu. Viņš uzsvēra, ka klasē jāapvieno skolēni ar vienādu sagatavotību, nodarbībām jānorinās mācību stundās, mācību vielu izskaidrotājs ir skolotājs, un pēc mācību stundas ir nepieciešams starpbrīdis.…
