Precīza Homo naledi fosiliju datēšana ir bijis grūts process. Sākotnējie mēģinājumi izmantot urāna sērijas attiecību metodes liecina par aptuveni 2,5 miljonu gadu vecumu, ieliekot Homo naledi laika posmā, kas radīja jautājumus par tā līdzāspastāvēšanu ar citām Homo sugām. Turpmākie pieklājības pasākumi, taču ir devuši vecuma aprēķinus, sākot no 335 000 līdz 236 000 gadiem, padarot klasifikācijas un līdzāspastāvēšanas scenārijus īpaši sarežģītus.
Situācijas, kurās tika noteiktas Homo naledi fosilijas, arī ir izraisījušas diskusijas. Daži apgalvo, ka fosiliju klātbūtne dziļajā un grūti sasniedzamā Dinaledi kamerā liecina par plānotu apbedīšanu, kas nozīmē sarežģītu uzvedību. Citi apgalvo, ka fosilijām vajadzēja iekļūt kamerā, izmantojot augu izcelsmes procesus, un spekulācijas par apbedīšanu joprojām ir konkurences tēma.
Bet, saka antropologs Džons Hoks, Rising Star komandas loceklis un dokumentu līdzautors: "Spēcīgākais pierādījums mums ir tas, ka apbedījumi izjauc alā esošo stratigrāfiju."
Homo naledi vecuma aprēķini palielina jautājumus par dažu hominīnu sugu iespējamo līdzāspastāvēšanu vienādā vietā. Ja jaunākā vecuma aplēses ir precīzas, Homo naledi, iespējams, vēlēsies dzīvot tikpat ilgi kā citas Homo sugas, jo mums ir stingras zināšanas par hominīnu mijiedarbību un konkurenci.